Несмотря на указание императора о том, что Новый Черкасск останется на выбранном месте,  казаки по-прежнему  отказывались покидать старый город. Новоявленная столица медленно, но все же росла. Историк Василий Сухоруков писал о ней так:

«План города Новочеркасска довольно хорош и расположен правильно. Он разделен на 76 кварталов, состоящих из 3-х тысяч мест, кои все избыточно снабжены землею. Места первого класса имеют по фасаду 20 саженей, второго — 15 и третьего — 10 саженей  по проспекту... Прямые широкие улицы и большие площади составляют собственную красоту Новочеркасска».

Долгое время город оставался малонаселенным. За полвека сюда перебралось всего 18 тысяч человек.